英特爾,聯想和華大今天宣布,這三家公司正在合作加快新冠肺炎新型冠狀病毒的基因組特征分析。英特爾和聯想的專業技術和生命科學專家將共同努力,為華大基因研究人員提供新的大數據分析技術和計算資源,進一步增強其基因測序工具的分析能力,更高效地研究新型冠狀病毒的基因組特征。
英特爾和聯想為華大基因提供的技術包括一個大型高性能計算集群,可用于處理從華大DNB SEQ-T7測序系統讀取的高通量數據。華大基因的研究人員將能夠通過新的高性能計算和基因組分析技術,以及來自英特爾和聯想的相關資源和專業知識,進一步加快對新型冠狀病毒基因組特征的研究。這項技術將支持科學家研究病毒模式的毒性和傳播,以及病原體和宿主之間的相互作用,從而為流行病學和疫苗設計研究做出貢獻。這些努力對于創造更好的診斷方法和設計有效的疫苗或其他保護措施(如免疫療法)是必要的。
通過這次合作,華大基因將繼續優化其新型冠狀病毒檢測試劑盒,并獲得大量有價值的信息。這些信息將有助于確定未來開發有效疫苗或治療的潛在目標方法。通過英特爾和聯想,聯想的共同努力,超級計算技術支持和優化了“基因組優化和可擴展性工具”(簡稱GOAST),該工具首先由英特爾?基因組分析工具獲得(經選定解決方案驗證),可將全基因組測序和全外顯子測序的計算速度加快40倍,幫助華大優化計算過程,高效處理數據,更快地生成可靠的基因組分析結果,從而縮短科研和臨床觀察的時間。
“目前,我們對這種新型冠狀病毒還有很多不了解的地方。通過分析病毒基因組數據,華大基因加速了對感染者的快速識別和基因組特征的研究,而這些任務需要巨大的計算資源,而這正是我們可以發揮作用的地方。”英特爾營銷集團副總裁兼中國區總經理王銳,表示:“因此,我們緊密合作,為在防疫第一線進行病毒研究的科學家提供更多的計算資源和專業支持,希望與狡猾的病毒賽跑,幫助防控疫情。拯救更多生命。”
聯想集團高級副總裁、企業技術集團總裁童夫堯,表示:“新型冠狀病毒疫情影響全國人民的心靈。作為世界領先的高性能計算制造商,聯想一直致力于為生命科學研究提供計算能力支持。來自英特爾和聯想的大數據分析以及健康和生命科學專家將整合我們的資源和專業知識,幫助解決當前面臨的嚴峻挑戰,并促進健康和生命科學的發展。”
在基因測序中,每毫升體液通常含有數百萬個不同的病毒體,每個病毒體的基因組含有約3萬個DNA堿基或字母。華大基因正在對許多感染患者和疑似感染患者的微生物進行測序,因此這些研究將產生大量的結核病水平甚至結核病水平的數據。為了高效快速地處理這些重要數據,需要采用更先進的HPC基礎設施、計算技術和優化的基因組分析方法。
總部設在深圳,的華大基因公司是專注于生命科學和基因研究的世界領先公司之一。基因首席信息官金表示:“基因已經對數百份臨床樣本進行了測序,以分析和區分感染的并發癥。生物信息學領域的技術,如基因組比對、基因組組裝、基因組注釋和病毒核酸片段的系統分析,是一個高密度的計算過程,因此充足的高性能計算對于提高分析效率非常重要。能夠使用最新的高性能計算和基因組分析技術是提高分析效率的重要因素。該設備和技術將加快新型冠狀病毒感染者的快速鑒定和病毒基因組特征的研究,為新型冠狀病毒精準的診斷、治療和疫情防控提供有力支持。”